与其他体系基本一样。要进行能源因素的辨识，识别优先控制的能源因素，进行法律法规的识别，设立目标、指标，针对优控因素制定管理方案、应急预案等。编制能源体系管理手册、程序性文件和作业指导书，可以和其他体系整合，完全融入到其他管理体系中，或直接在其他体系文件中增加能源管理的要求。然后就是运行控制，检测能源绩效，开展体系内审、管理评审等。在认证之前必须使体系运行3—6个月，进行了完整的内审与管理评审，并得到闭环。
需要向认证公司提交的资料有：能源管理体系手册、程序性文件、企业合法经营证明、企业能源介质和耗能工质的种类、年使用量、企业规模、各工序的工序能耗、综合能耗等。
一般情况下，各种能耗指标需要达到清洁生产的二级标准，否则不能通过。
具有能源体系认证资质的机构目前不多。由于是刚刚试点，目前具备资质的有31家认证机构。其中比较权威的是北京国金恒信管理体系认证有限公司、中国船级社质量认证公司、北京新世纪认证有限公司、中国质量认证中心等，每家机构都针对不同的行业，应按所属行业选择合适的认证机构。

1 北京国金恒信管理体系认证有限公司 钢铁
2 中国船级社质量认证公司 钢铁
3 英标管理体系认证(北京)有限公司 纺织
4 北京埃尔维质量认证中心 纺织
5 联合信诚认证（北京）中心 煤炭
6 北京新世纪认证有限公司 煤炭
7 北京中大华远认证中心 造纸
8 通标标准技术服务有限公司 造纸
9 中电联（北京）认证中心 电力
10 上海英格尔认证有限公司 电力
11 中国质量认证中心 有色金属
12 北京联合智业认证有限公司 有色金属
13 北京三星九千认证中心 化工-石油化工
14 北京世标认证中心有限公司 化工-石油化工
15 四川三峡认证有限公司 化工-煤化工
16 北京中安质环认证中心 化工-煤化工
17 北京中化联合认证有限公司 化工-基础化工
18 华夏认证中心有限公司 化工-基础化工
19 中国建筑材料检验认证中心 建材-玻璃
20 方圆标志认证集团有限公司 建材-玻璃
21 北京国建联信认证中心公司 建材-水泥
22 中质协质量保证中心 建材-水泥
23 广东中鉴认证有限责任公司 建材-陶瓷
24 深圳市环通认证中心 轻工-食品
25 杭州万泰认证有限公司 轻工-食品
26 上海环科环境认证有限公司 轻工-家电
27 北京东方纵横认证中心 轻工-制革
28 上海质量体系审核中心 机械制造-通用机械
29 中国电子技术标准化研究所 机械制造-通用机械
30 华信技术检验有限公司 机械制造-电力机械
31 中油健康安全环境认证中心 机械制造-化工机械